Phó Tổng cục trưởng Nguyễn Công Bình
a) Vụ Pháp chế;
b) Vụ Hợp tác quốc tế;
c) Vụ Tổ chức cán bộ;
d) Vụ Tài vụ - Quản trị;
đ) Văn phòng (có đại diện tại thành phố Hồ Chí Minh);
e) Thanh tra;
g) Cục Giám sát quản lý về hải quan;
h) Cục Thuế xuất nhập khẩu;
i) Cục Điều tra chống buôn lậu;
k) Cục Kiểm tra sau thông quan;
l) Cục Công nghệ thông tin và Thống kê hải quan;
m) Trung tâm Phân tích, phân loại hàng hóa xuất nhập khẩu (có Chi nhánh ở một số khu vực);
n) Viện Nghiên cứu Hải quan;
o) Trường Hải quan Việt Nam;
p) Báo Hải quan.
01 - Cục Hải quan thành phố Hà Nội
02 - Cục Hải quan thành phố Hồ Chí Minh
03 - Cục Hải quan thành phố Đà Nẵng
04 - Cục Hải quan thành phố Hải Phòng
05 - Cục Hải quan thành phố Cần Thơ
06 - Cục Hải quan tỉnh An Giang
07 - Cục Hải quan tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu
08 - Cục Hải quan tỉnh Bình Định
09 - Cục Hải quan tỉnh Bình Dương
10 - Cục Hải quan tỉnh Bình Phước
11 - Cục Hải quan tỉnh Cà Mau
12 - Cục Hải quan tỉnh Cao Bằng
13 - Cục Hải quan tỉnh Đắk Lắk
14 - Cục Hải quan tỉnh Đồng Nai
15 - Cục Hải quan tỉnh Đồng Tháp
16 - Cục Hải quan tỉnh Điện Biên
17 - Cục Hải quan Gia Lai - Kon Tum
18 - Cục Hải quan tỉnh Hà Giang
19 - Cục Hải quan tỉnh Hà Tĩnh
20 - Cục Hải quan tỉnh Kiên Giang
21 - Cục Hải quan tỉnh Khánh Hoà
22 - Cục Hải quan tỉnh Lạng Sơn
23 - Cục Hải quan tỉnh Lào Cai
24 - Cục Hải quan tỉnh Long An
25 - Cục Hải quan tỉnh Nghệ An
26 - Cục Hải quan tỉnh Quảng Bình
27 - Cục Hải quan tỉnh Quảng Nam
28 - Cục Hải quan tỉnh Quảng Ninh
29 - Cục Hải quan tỉnh Quảng Ngãi
30 - Cục Hải quan tỉnh Quảng Trị
31 - Cục Hải quan tỉnh Tây Ninh
32 - Cục Hải quan tỉnh Thanh Hoá
33 - Cục Hải quan tỉnh Thừa Thiên Huế
34 - Cục Hải Quan tỉnh Bắc Ninh
b) Các Chi cục Hải quan: Đội Kiểm soát Hải quan và đơn vị tương đương thuộc Cục Hải quan tỉnh, liên tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương.
Việc thành lập, sáp nhập, giải thể các Chi cục Hải quan, Đội Kiểm soát Hải quan và đơn vị tương đương do Bộ trưởng Bộ Tài chính quyết định.
c) Các đơn vị quy định tại điểm a và điểm b khoản này có tư cách pháp nhân, con dấu riêng, được mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước theo quy định của pháp luật.