Theo Quyết định số 1024/QĐ-BTC ngày 11/5/2010 của Bộ Tài chính, Trường  Hải quan Việt Nam có vị trí và chức năng, nhiệm vụ và quyền hạn, cơ cấu tổ chức như sau:

Vị trí và chức năng

1. Trường Hải quan Việt Nam là đơn vị sự nghiệp trực thuộc Tổng cục Hải quan, có nhiệm vụ giúp Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan tổ chức thực hiện công tác đào tạo, bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ cho cán bộ, công chức trong ngành hải quan; tổ chức đào tạo, cung cấp các dịch vụ, tư vấn về đào tạo bồi dưỡng có liên quan đến lĩnh vực hải quan cho tổ chức, cá nhân trong và ngoài nước.

2. Trường Hải quan Việt Nam có tư cách pháp nhân, con dấu riêng, được mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước và ngân hàng theo quy định của pháp luật.

Nhiệm vụ

1. Xây dựng chiến lược phát triển Trường Hải quan Việt Nam trong tổng thể chiến lược phát triển ngành hải quan báo cáo Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan để trình Bộ trưởng Bộ Tài chính xem xét, quyết định.

2. Trình Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan:

a) Kế hoạch thực hiện đào tạo, bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ cho cán bộ, công chức ngành hải quan hàng năm;

b) Kế hoạch biên soạn, phát hành giáo trình, tài liệu đào tạo, bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ về hải quan.

3. Xây dựng và thực hiện đào tạo, bồi dưỡng đội ngũ giảng viên kiêm chức, giáo viên nghiệp vụ của ngành hải quan.

4. Tổ chức đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, công chức của ngành hải quan theo kế hoạch được cấp có thẩm quyền phê duyệt.

5. Đào tạo, bồi dưỡng chính sách pháp luật, nghiệp vụ về hải quan cho cộng đồng doanh nghiệp.

6. Hợp tác, liên kết với các cơ sở đào tạo trong và ngoài nước để thực hiện nhiệm vụ đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, công chức của ngành hải quan theo quy định của pháp luật.

7. Tổ chức nghiên cứu khoa học phục vụ công tác đào tạo trong lĩnh vực hải quan.

8. Cung cấp các dịch vụ tư vấn, về đào tạo, bồi dưỡng các kiến thức liên quan đến lĩnh vực hải quan cho các tổ chức, cá nhân trong và ngoài nước.

9. Thực hiện chế độ thông tin báo cáo, thống kê về công tác đào tạo bồi dưỡng theo chế độ quy định; tổng hợp, đánh giá kết quả thực hiện nhiệm vụ được giao.

10. Quản lý cán bộ, viên chức và quản lý tài chính, tài sản được giao theo quy định của pháp luật và phân cấp quản lý cán bộ của Bộ Tài chính.

11. Thực hiện các nhiệm vụ khác do Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan và theo quy định của pháp luật.

Quyền hạn

1. Được yêu cầu các đơn vị, cá nhân cung cấp văn bản, hồ sơ, tài liệu có liên quan đến việc thực hiện nhiệm vụ được giao theo quy định của pháp luật.

2. Ký các văn bản hướng dẫn, giải thích, trả lời hoặc quan hệ công tác thuộc lĩnh vực quản lý của Trường.

3. Được liên kết, hợp tác với các tổ chức và cá nhân trong và ngoài nước để thực hiện nhiệm vụ đào tạo, bồi dưỡng cán bộ hải quan và cung cấp các dịch vụ, tư vấn về lĩnh vực đào tạo hải quan phù hợp với chức năng, nhiệm vụ được giao và theo quy định của pháp luật.

4. Cấp chứng chỉ cho học viên đã qua các lớp đào tạo, bồi dưỡng do Trường tổ chức theo quy định của pháp luật.

Cơ cấu tổ chức

Cơ cấu tổ chức của Trường Hải quan Việt Nam gồm:

1. Khoa Kiến thức tổng hợp và Ngoại ngữ.

2. Khoa Thông quan.

3. Khoa Kiểm tra sau thông qua và Kiểm soát hải quan.

4. Phòng Đào tạo và Quản lý học viên.

5. Văn phòng.

Quy chế hoạt động của Trường Hải quan Việt Nam; nhiệm vụ cụ thể của các phòng, khoa, văn phòng do Tổng cục trưởng Tổng cục Hải quan quy định.